Atmosfæren i Neptune er lik alle de store planetene i solsystemet; det består stort sett av hydrogen og helium, med spor av metan, vann, ammoniakk og andre is. Det er metan i planetens øvre atmosfære som gir den sin knallblå farge.
I de høyeste høyder, der Neptunens atmosfære berører verdensrommet, består den av rundt 80% hydrogen og 19% helium. Det er også en sporbar mengde metan. Lyset vi ser fra Neptun er faktisk det reflekterte lyset fra sola. Selv om hele lysspekteret treffer Neptune. Denne sporbare mengden metan absorberer lys fra den røde enden av spekteret, mens den blå lyset kan sprette ut igjen. Fargen på Neptuns atmosfære er lysere enn Uranus, som har en lignende atmosfære; astronomer er ikke sikre på hvorfor det er så dramatisk fargeforskjell.
De øverste nivåskyene på Neptun forekommer på det punktet der trykket er lavt nok til at metan kondenserer. Astronomer har fotografert disse skyene i høyden og dannet skygger på det nedre skyltdekket nedenfor. Dypere nede i Neptun bør temperaturene komme opp til 0 C, der det kan dannes vannskyer.
Som med de andre planetene, er atmosfæren i Neptune brutt opp i distinkte bånd av stormer. Faktisk forekommer de raskeste vindene i solsystemet ved Neptune - vindene er klokket til 2400 km / t (1500 miles per time). Noen stormer kan vokse seg store og forbli i lange perioder. Neptune har sin egen Great Dark Spot, lik Great Red Spot på Jupiter.
Vi har skrevet mange artikler på Space Magazine om atmosfæren i Neptun og stormene. Her er en artikkel om været om våren på Neptun, og hvordan Neptuns sørpol kan være det varmeste stedet på planeten.
Hvis du vil ha mer informasjon om Neptune, kan du ta en titt på Hubblesites nyhetsmeldinger om Neptune, og her er en lenke til NASAs Solar System Exploration Guide to Neptune.
Vi har spilt inn en hel episode av Astronomy Cast omtrent Neptun. Du kan høre på det her, avsnitt 63: Neptune.